Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HLA-DMAP28067 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms