Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
XBP1P17861 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms