Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms