Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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