Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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