Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms