Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms