Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTC7AQ9ULT0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms