Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms