Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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