Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms