Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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