Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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