Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms