Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms