Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBM43Q6ZSC3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms