Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6P435 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6P435 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6P435 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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