Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms