Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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CTXN3Q4LDR2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CTXN3Q4LDR2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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