Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPVD1Q14C86 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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