Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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