Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms