Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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