Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms