Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPL23P62829 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPL23P62829 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPL23P62829 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPL23P62829 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms