Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms