Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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