Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms