Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MLH1P40692 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms