Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms