Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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