Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MARCKSP29966 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms