Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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