Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms