Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF4P18085 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms