Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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