Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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