Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms