Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F6O75461 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F6O75461 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
E2F6O75461 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
E2F6O75461 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F6O75461 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms