Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms