Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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HOXA3O43365 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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HOXA3O43365 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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HOXA3O43365 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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HOXA3O43365 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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HOXA3O43365 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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HOXA3O43365 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
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