Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms