Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms