Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC7AQ9ULT0 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC7AQ9ULT0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC7AQ9ULT0 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC7AQ9ULT0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TTC7AQ9ULT0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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TTC7AQ9ULT0 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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TTC7AQ9ULT0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTC7AQ9ULT0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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