Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms