Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms