Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RAB9BQ9NP90 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RAB9BQ9NP90 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RAB9BQ9NP90 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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