Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TREX2Q9BQ50 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TREX2Q9BQ50 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TREX2Q9BQ50 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TREX2Q9BQ50 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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