Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3GL2Q99962 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3GL2Q99962 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms