Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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